Während der Schwangerschaft sollte Lapacho nicht eingenommen, sondern nur äußerlich angewendet werden, da der Inhaltsstoff Lapachol im Tierversuch toxisch für Föten war.
Bei einer Störung der Blutgerinnung darf Lapacho nicht angewendet werden.
Bei der Anwendung als Bad kann Lapacho allergische Reaktionen der Haut und der oberen Atemwege auslösen.
Als weitere Nebenwirkungen können Übelkeit, Bauchschmerzen, Durchfall, Anämie, Blutungsneigung und Verlangsamung der Blutgerinnung auftreten.
