Es sind keine Gegenanzeigen bekannt.
Teebaumöl besitzt sensibilisierende Eigenschaften und kann bei der äußerlichen Anwendung Ausschläge auf der Haut und der Schleimhaut auslösen. Je älter das Öl ist, umso größer ist die enthaltene Allergenmenge.
Bei der innerlichen Anwendung kann es zu Vergiftungserscheinungen kommen. Diese äußern sich durch Muskelzittern, Koordinationsprobleme, Schwäche und zentralnervöse Störungen. Bei Tieren können Vergiftungserscheinungen auch bei äußerlicher Verwendung auftreten.