Analfisteln nehmen oft ihren Ausgang von Abszessen. Abszesse sind abgekapselte, eitrige Entzündungsherde. Am Anus entstehen Abszesse meist durch Entzündungen, die sich in Vertiefungen der Schleimhaut (Krypten) entwickeln, auf Drüsen übergreifen und sich dort abgrenzen. Die Abszesse bilden dann häufig Fisteln, also Verbindungsgänge nach außen oder zu anderen Körperstrukturen.
Weitere mögliche Ursachen zur Entstehung von Analfisteln sind insbesondere chronisch-entzündliche Darmerkrankungen (Morbus Crohn, Colitis ulcerosa), aber bisweilen auch andere Entzündungen, Verletzungen oder Tumore.
