Bei jedem Patienten verläuft die Bechterewsche Erkrankung anders. Viele Patienten klagen vor allem über Entzündungschmerzen, bei anderen steht wiederum die Versteifung im Vordergrund. Bei einigen Patienten kann die Erkrankung sehr aggressiv verlaufen, bei anderen verläuft sie dagegen so mild, dass sie nie eindeutig diagnostiziert werden kann. Auch die Symptome können sehr unterschiedlich sein. Bei einigen sind die Gelenke der Gliedmaßen mit betroffen, bei manchen Patienten die inneren Organe, bei anderen beschränkt sich die Krankheit ganz auf die Wirbelsäule. Durch eine gezielte Therapie und eigenes aktives Verhalten lässt sich der Ausmaß der Behinderung entscheidend beeinflussen. Der Krankheitsverlauf ist üblicherweise gekennzeichnet durch:
Kommt es zu einem Ausbruch der Krankheit bereits vor dem 16. Lebensjahr, so wird dies oft als Vorzeichen für einen schweren Krankheitsverlauf angesehen.