Zur Diagnose von Infektionen können neben einem Abstrich auch andere Methoden zur Gewinnung von Krankheitserregern durchgeführt werden. Dazu gehören z. B. Proben von abgesaugtem oder ausgehustetem Sekret, Spülungen, Stuhl- und Urinproben sowie Blutproben.
Im Rahmen der Zytologie (Zelldiagnostik) kann auch eine Probeentnahme (Biopsie) von Gewebe sinnvoll sein, um dann eine feingewebliche Untersuchung (Histologie) vorzunehmen.
Zur DNA-Bestimmung eignen sich neben Zellen aus einem Wangenausstrich auch alle anderen Materialien, die Zellen der jeweiligen Person enthalten (z. B. Blutproben, Spermien).
