Die Bronchoskopie dient der Abklärung von Erkrankungen in den Bronchien sowie in der Luftröhre. So wird die Methode beispielsweise eingesetzt, um einen chronischen Husten abzuklären oder um unklaren, auffälligen Befunden im Röntgenbild der Lunge nachzugehen. Die Bronchoskopie ist eine wichtige Untersuchung beim Verdacht auf Tumoren, z. B. Lungenkrebs (Bronchialkarzinom), und beim Verdacht auf infektionsbedingte Entzündungen, z. B. Lungenentzündung (Pneumonie), Abszesse (abgegrenzte Entzündungsherde) oder Infiltrate (Einlagerungen) von Krankheitserregern. Weiterhin kann die Bronchoskopie bei einem in die Bronchien eingedrungenen Fremdkörper angezeigt sein, um diesen zu entfernen.