Wichtig für eine erfolgreiche Behandlung ist es, die Ursache des Ekzems festzustellen. Der Arzt führt zunächst ein Gespräch mit dem Patienten (Anamnese). Die Analregion wird betrachtet und eventuell abgetastet. Im Anschluss erfolgen spezielle Untersuchungen, die sich nach dem Verdacht auf den Auslöser des Hautausschlages richten. Durch eine Mastdarmspiegelung können mögliche Analerkrankungen festgestellt werden. Der Hautarzt untersucht auch die restliche Haut auf andere Stellen mit Auffälligkeiten. Beim Verdacht auf ein allergisches Kontaktekzem kann ein Hauttest zur Feststellung einer Allergie vorgenommen werden.
Insbesondere bei länger andauernden Ekzemen muss eine Krebserkrankung oder eine Vorstufe zum Krebsbefall ausgeschlossen werden. Des Weiteren sollten andere Hauterkrankungen oder eine Infektion mit Bakterien, Viren oder Pilzen ausgeschlossen werden.