Am Patienten erfolgt lediglich die Entnahme der Probe, die auf Bakterien untersucht werden soll. Je nach der Entzündung kann z. B. eine Stuhlprobe, eine Urinprobe, eine Blutprobe, ein Abstrich (Abnehmen/Abkratzen einer Probe von einer Oberfläche) oder eine weitere Art der Probengewinnung vorgenommen werden. Das Präparat wird in einen geeigneten Behälter gegeben, der oft bereits ein Nährmedium enthält. Die Probe wird dann in ein Labor geschickt und dort mit den jeweils erforderlichen Methoden untersucht. Das Ergebnis kann manchmal rasch feststehen (z. B. bei bloßer Mikroskopie) oder wird nach einem bis mehreren Tagen an den behandelnden Arzt weitergeleitet.