Zu den bakteriellen Infektionen können beispielsweise gehören: abgekapselte Entzündungsherde (Abszess), bestimmte Entzündungen der Haut (z. B. Erysipel), Wundinfektionen, Entzündungen der Atemwege, Mandelentzündung (Tonsillitis), Mittelohrentzündung (Otitis media), Lungenentzündung (Pneumonie), Magenentzündung (Gastritis), Darmentzündung (Enteritis), Blinddarmentzündung (Appendizitis), Harnwegsinfekte, Syphilis, Tuberkulose sowie viele weitere Erkrankungen. Wird die Infektion über das Blut im ganzen Körper verteilt, so wird dies Sepsis („Blutvergiftung") genannt. Eine große Vielzahl von verschiedenen Bakterien kann für Infektionskrankheiten verantwortlich sein.
In der Medizin dient der Nachweis von Bakterien dazu, eine gezielte Behandlung (meist mit Antibiotika) vornehmen zu können, um die Krankheit möglichst rasch und effizient zu bekämpfen.
