Während der Schwangerschaft oder Stillzeit sollte Thymian nicht eingenommen werden.
Bei Überempfindlichkeit gegenüber Lippenblütlergewächsen, Birkenpollen und Sellerie ist von einer Anwendung abzuraten.
Liegen eine Herzschwäche, große Hautverletzungen, Hautkrankheiten und infektiöse Erkrankungen vor, sollten Thymian-Bäder nur nach Rücksprache mit einem Arzt angewendet werden.
Bei Überdosierung kann es zu Übelkeit, Erbrechen und Leibschmerzen kommen.
Es können allergische Reaktionen auftreten.